Tanszékünk kiemelt hangsúlyt fektet a kutatási tevékenységek végzésére. Jelenleg az alábbi témákban zajlanak vizsgálatok:

• Magyarországi denevérek ürülékének vizsgálata flavivírusok és pestivírusok jelenlétére (Dr. Dénes Lilla) 
• A sertés bélsármikrobiom-összetételének molekuláris vizsgálata a rotavírusok jelenlétének és genetikai variabilitásának tükrében (Dr. Dénes Lilla, Dr. Igriczi Barbara) 
• A nukleáris faktor-kappa B (NF-kB) jelenlétének és szerepének vizsgálata hisztopatológiai és molekuláris biológiai módszerekkel macskák egyes daganataiban (Dr. Szilasi Anna) 
• “Emerging pathogens” vizsgálata macskák szövetein (Dr. Szilasi Anna)
• Macskák bélgyulladásának és low grade alimentáris lymphomájának elkülönítése molekuláris biológiai módszerekkel (PARR) (Dr. Szilasi Anna)
• Kutya vesebiopszia minták kórszövettani és elektronmikroszkópos vizsgálata (Dr. Szilasi Anna)
• Az átoltható (vírusos) mirigyesgyomor-gyulladás vizsgálata hazai mintákon (Dr. Dobra Péter)
• Sertéscirco– és parvovírusok fertőzésdinamikai és összehasonlító genetikai vizsgálata nagylétszámú sertésállományokban (Dr. Igriczi Barbara)
• Frontvonalbeli technológiák alkalmazása kórokozók, környezet és sertések szűrésére a jobb betegségkontroll érdekében a sertéstelepeken (Use of frontline technologies to screen pathogens, environment and pigs for a better disease control in swine herds) (Dr. Balka Gyula, Dr. Dénes Lilla, Dr. Igriczi Barbara)
• Haszonállat metagenomikai adatok feldolgozása (Dr. Szenes Áron)
• Állati hemosztázis tesztek fejlesztése (Dr. Szenes Áron)