KUTATÓCSOPORT-VEZETŐ: Dr. Solymosi Norbert
ELÉRHETŐSÉG: [E-mail megjelenítése]
A KUTATÓCSOPORT TAGJAI:
Egyetemi tanár: Dr. Csabai István (ELTE Komplex Rendszerek Fizikája Tanszék), Dr. Farkas Róbert, Dr. Szállási Zoltán (Harvard Medical School)
Egyetemi docens: Dr. Makrai László, Dr. Solymosi Norbert
Egyetemi adjunktus: Dr. Maróti-Agóts Ákos
Tudományos munkatárs: Dr. Spisák Sándor (Harvard Medical School, Dana Farber Cancer Institute, Medical Oncology Department), Dr. Valcz Gábor (SE, II. Belgyógyászati Tanszék és Klinika, Molekuláris Gasztroenterológiai Laboratórium)
PhD hallgató: Dr. Adorján András
KUTATÁSI TERÜLETEK:
Az utóbbi két évtizedben olyan molekuláris biológiai módszerek (microarray, új generációs szekvenálás (NGS)) jelentek meg és váltak mindennapossá a genomikai kutatások területén, amelyek jelentős informatikai szakértelmet és hátteret igényelnek. A molekuláris biológusok számára nem csak a módszerek elsajátítása és alkalmazása jelent kihívást, hanem az eredmények kiértékelése és értelmezése is.
Csoportunk célja, hogy katalizálja a bioinformatikai kutatásokat a terület hazai és külföldi szakértőinek összefogásával, segítve ezzel az Állatorvostudományi Egyetemen, illetve társtudományi intézményekben folyó kapcsolódó kutatásokat.
Különböző, nagy áteresztőképességű bioinformatikai technológiákból származó adatok feldolgozását, elemzését végezzük. A digitális képfeldolgozás segítségével kvantitatív bakteriológiai, patológiai kutatásokat támogatunk. Génexpressziós microarray technológiából származó adatok alapján biomarker azonosítást, rendszerbiológiai elemzéseket végzünk. Különböző kutatási céloknak (pl. mikrobiom, polimorfizmus, metilációs mintázat) megfelelő új generációs szekvenálási adatok elemzését végezzük.
HOSSZÚTÁVÚ EGYÜTTMŰKÖDÉSEK:
Endokrin Neurobiológia Kutatócsoport, Magyar Tudományos Akadémia Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézete
Komplex Rendszerek Fizikája Tanszék, Eötvös Lóránd Tudományegyetem
II. Belgyógyászati Tanszék és Klinika, Molekuláris Gasztroenterológiai Laboratórium, Semmelweis Egyetem
Harvard Medical School, Dana Farber Cancer Institute, Medical Oncology Department
IGÉNYELHETŐ SZOLGÁLTATÁSOK:
Kvantitatív digitális képfeldogozás
Génexpressziós microarray adatok elemzése
NGS adatok elemzése
PÁLYÁZATOK:
Támogató szervezet /forrás megnevezése | Pályázati projekt címe és témája | Támogatás összege (Ft-ban) |
EU H2020 | Horizon 2020 PHC7 ”COMPARE”: új genomikai technológiákra alapozva humán és állati fertőzések detektálásának és azokra adott válaszok felgyorsítását célzó fejlesztések, kutatások, integráció. | 6400,000,000 (20,000,000 €) |