magyar
kötelező
gyakorlati jegy + vizsga (kollokvium)
2
2
3+2
45
30
Zoológiai Tanszék
Dokumentumtár
- Biológia BSc
A kurzus leírása
tantárgyfelelős: Dr. Kövér Szilvia, oktatók: Dr. Kövér Szilvia, Dr Pásztory-Kovács Szilvia
A populációgenetika és evolúcióbiológiai koncepciók megjelenésének és fejlődésének tudománytörténeti háttere. Részletesen tárgyaljuk és a laboratóriumban begyakoroltatjuk azokat az alapvető populáció- és evolúció-genetikai modelleket, amelyeknek megértése szükséges a zoológus, etológus, konzervációbiológus munkájához. A tárgyalt fogalmak és összefüggések: szelekció, mutáció, migráció, genetikai sodródás klasszikus modelljei. Neutrális mutációs evolúció, evolúciós óra. Biológiai szekvenciák összerendezése, összehasonlítása. Szekvenciák használata törzsfa-rekonstrukcióhoz. Fajfogalom, kladogenezis.
kötelező:
Előadások anyaga, képletgyűjtemény: www.univet.hu
Ajánlott:
Pecsenye Katalin: Populációgenetika
Freeman és Herron: Evolutionary analysis
Előadások tematikája
1. hét: Mi az evolúció? Tudománytörténeti bevezetés. A természetes szelekció és az adaptáció. Az ideális populáció, HWE.
2. hét: Fitnesz, szelekció formái, az evolúció sebessége a szel során. Polimorfizmus, Wright tétele. Szelekció egyed alatti és feletti szinten. Gyakoriság- és sűrűségfüggő szelekció
3. hét: Sodródás. Beltenyésztés.
4. hét: Migráció, metapopuláció, genetikai távolság. FST, Nei genet távolság. Konzervációgenetika.
5. hét: A neutrális elmélet: szubszt ráta, fix valósz, fix idő, molek evol sebessége.
6. hét: Rekombináció, géntérképezés, kapcsoltsági egyensúly. Mut-szel- egyensúly. mut teher, rek teher, szegr teher.
7. hét: Filogenetikai elemzések. Szekvenciák keresése, illesztése, törzsfaszerkesztés, evolúciós összehasonlító módszerek.
8. hét: Kvantitatív genetika, Genetikai változatosság felosztása, Rokonok közötti hasonlóság, mesterséges szel.
9. hét: QTL-mapping, kandidáns gén módszer, Mutációk típusai és szerepük a genom-evolúcióban. A prok,/euk genom evol, prok ivaros folyamatok, horizontális géntranszfer, plazmidok.
10. hét: Ivarosság evolúciója. Ivarosság következményei, szexuális szelekció.
11. hét: Makroevolúció: speciáció, adaptív radiáció, „punctuated equilibrium vs gradualism”, koevolúció.
12. hét: Evolúciós játékelmélet. Konfliktus és kooperáció fajon belül. Rokonszelekció és szociális viselkedés. Az egyedfejlődés evolúciója.
13. hét: Az élet keletkezése és az evolúció nagy lépései. A földi élet története. Az ember evolúciója.
14. hét:
15. hét:
Gyakorlatok tematikája
1. hét: Valószínűségsz., Bayes-tétel; Mendeli öröklésmenetek, családfaelemzések, binomiális eloszlás
2. hét: Hardy-Weinberg egyensúly, khi-négyzet teszt, enzim-polimorfizmus, allélgyakoriságok, genotípus-gyakoriságok
3. hét: ZH1
4. hét: Természetes szelekció
5. hét: Genetikai sodródás, beltenyésztés, effektív populációméret
6. hét: Fixációs index (FST), fixálódás valószínűsége.
7. hét: ZH2
8. hét: NCBI szekvencia keresés, illesztés.
9. hét: Törzsfa-készítés.
10. hét: Sodródás szimulációk, Populációszerkezet, HW egyensúlytól való eltérés, F-statisztikák.
11. hét: Kapcsoltsági egyensúly, mutációs-szelekciós egyensúly.
12. hét: Kvantitatív genetika.
13. hét: ZH3
14. hét:
15. hét:
Értékelés leírása
Előadás: szóbeli vizsga
Gyakorlati jegy: 3ZH + Önálló törzsfakészítési feladat
Előtanulmányi követelmény: Genetika
Vizsgainformáció
Szóbeli vizsga, tételjegyzék alapján. Képletgyűjtemény használható.
