A kurzus leírása

Alapvető programozási, kód-írási készségek elsajátítása R nyelven: Programok struktúrája: ciklus, elágazás, alprogramok. A véletlen folyamatok modellezése randomszámokkal. Dinamikai modellek elemzésére használatos ábratípusok. A Biomatematikai modellek tantárgy keretében megismert időben diszkrét modellek elemzése determinisztikus és sztochasztikus szimulációkkal. Differenciál-egyenletek numerikus megoldása.

• Gyakorlatok anyaga, képletgyűjtemény: www.univet.hu
• Sarah P. Otto & Troy Day: A Biologist’s Guide to Mathematical Modeling in Ecology and Evolution, Princeton University Press, 2011
• GILLMAN, M.: An Introduction to Mathematical Models in Ecology and Evolution, Wiley-Blackwell, 2009
• WILSON, E.O. – BOSSERT, W.H.: Bevezetés a populációbiológiába,
  Budapest: Gondolat, 1981.
• SOETAERT, K. – HERMAN, P.M.J.: A practical Guide to Ecological Modeling, Springer, 2009

---

Előadások tematikája

Hét:	Téma:
1. 09/11	Diszkrét populációdinamikai modellek, korlátozott, korlátlan populációnövekedés. Ábra: denzitás az idő függvényében. Vektorok, ciklusok.
2. 09/18	Ábra: denzitás az előző denzitás fvben (Ricker diagramm) Függvények mint összekapcsolt utasítások, függvények mint változók közötti függvénykapcsolat.
3. 09/25	Mátrixok és felhasználásuk a a denzitás növekedési paramétertől való függésének ábrázolásában.
4. 10/02	Egy folytonos függvény többszörös ábrázolása egy ábrán a paraméterfüggés szemléltetésére. Az elágazás használata a programozásban. Logikai változók.
5. 10/09	Az időbeliség szemléltetése nyilakkal a Ricker-diagrammon. Korcsoportfüggő populációdinamika, Leslie-mátrix.
6. 10/16	Determinisztikus haploid és diploid egylókuszos populációgenetikai modell. Mutáció és szelekció modellezése. Ábra: átlagfitnesz és deltap a p függvényében (Wright-féle adaptív tájkép).
7. 10/30	Sztochasztikus populációgenetikai modellek. Listák, randomszámok. Diploid sztochasztikus populációgenetikai modell. Mutáció és szelekció.
8. 11/06	Haploid soklókuszos sztochasztikus populációgenetikai modell. Mutáció, szelekció és rekombináció. Mutáns-osztályok.
9. 11/13	Váltivarúság modellezése. A szaporodási mód modellezése: pánmixis, öntermékenyítés, apomixis. A szaporodási mód modellezése: ivari szelekció.
10. 11/20	Differenciál-egyenletek numerikus megoldása. Egyéni feladatok megbeszélése.
11. / 11/27	Többváltozós differenciál-egyenlet-rendszerek numerikus megoldása. Egyéni feladatok 1. számonkérés.
12. 12/04	Játékelméleti modell, gyakoriságfüggés. Egyéni feladatok 2. számonkérés.
13. 12/11	Egyéni feladatok 3. számonkérés.

Értékelés leírása

A gyakorlatok látogatása kötelező, max 3 hiányzás lehet.

10 kisdolgozat 5-5 pont értékben = max 50 pont. A kisdolgozatok során bármely papír alapú segédeszköz használható, de elektronikus nem.

1 beadandó egyéni feladat: időben diszkrét modell megoldására szimuláció elkészítése és elemzése.  max 50 pont (40 pont a modell kódolása, 5 pont a programozás struktúráltsága és a megjegyzések, 5 pont az ábra.)

Beküldhető házi feladatok 1-3 pont értékben, összesen max 15 pont szerezhető.

• jeles: 90%
• jó: 80%
• közepes: 65%
• elégséges: 50%

Vizsga információk

A tantárgyhoz nem tartozik vizsga.